Comment fonctionne le système de Modules

Les commandes module sont disponibles sur EOS

Les commandes modules permettent de personnaliser son environnement en termes de compilateurs, librairies, application (calcul, visu, etc...) de manière extrêmement simple.

Pour connaà®tre son environnement courant :

[@eoslogin1 ]$ module list
Currently Loaded Modulefiles:
  1) oscar-modules/1.0.3   2) intel/14.0.2.144      3) intelmpi/4.1.3.049

Cela signifie que les versions 14.0.2 des compilateurs d’Intel (librairies MKL comprises) sont disponibles dans votre environnement actuel ainsi que la librairie MPI Intel MPI version 4.1.3

Pour connaitre l’ensemble des modules disponibles (d’autres infos sur les logiciels disponibles sur EOS) :

[@eoslogin1 ]$ module available
---------------------------------------------------------------------------------- /opt/modules/modulefiles ----------------------------------------------------------------------------------
bullxde/3.0                  bullxmpi/bullxmpi-1.2.7.1    oscar-modules/1.0.3(default)

------------------------------------------------------------------------------- /usr/local/modules/modulefiles -------------------------------------------------------------------------------
cdo/1.6.4                                  intel/11.1                                 intelmpi/4.1.3.049(default)                openmpi/1.8.2
ffmpeg/25062014                            intel/11.1.064                             intelmpi/5.0.1.035                         paraview/4.1.0
fftw/3.3.4_openmp                          intel/12.1.5                               itac/9.0.1                                 pnetcdf/1.5.0_intelmpi
gcc/4.6.0                                  intel/13.1.1                               meep/1.2.1                                 python/2.7.6
geris/260614                               intel/14.0.2.144(default)                  mpiprof_bullxmpi/bullxmpi1.2.7.1_compilo14 R/3.1.1
gsl/1.16_intel                             intel/15.0.090                             mpiprof_intelmpi/intelmpi4_compilo14       totalview/8.13
hdf5/1.8.13                                intel/2011.sp4                             ncl/6.2.0                                  vtune/2013.17
hdf5/1.8.13_bullxmpi                       intel/mkl.11.0.5                           nco/4.4.4                                  vtune/2015.0
hypre/2.9.0bbullxmpi                       intel-fc-9/9.1                             netcdf/4.3.2
hypre/2.9.0bbullxmpimkl                    intelmpi/3.2.2.006                         openbugs/3.2.3

Pour changer de version de compilateur :

[@eoslogin1]$ module switch intel/14.0.2.144 intel/15.0.090 
Intel Parallel Studio XE 2013 unloaded
Intel Parallel Studio XE 2015 loaded
Intel Parallel Studio XE 2013 unloaded
[@eoslogin1]$ module list
Currently Loaded Modulefiles:
  1) oscar-modules/1.0.3   2) intel/15.0.090        3) intelmpi/4.1.3.049
module switch intel/14.0.2.144 intel/15.0.090 
module list

Pour charger et lancer le deboggeur parallèle Totalview :

[@eoslogin1]$ module load totalview
[@eoslogin1]$ module list
Currently Loaded Modulefiles:
  1) oscar-modules/1.0.3   2) intel/15.0.090        3) intelmpi/4.1.3.049    4) totalview/8.13
[@eoslogin1]$ totalview&

(ce nom est donné par la commande : module list ou module avail)

Les principales commandes :

Pour voir les modules déjà chargés dans votre environnement :

module list

Pour voir les différents modules disponibles :

module avail

Pour voir les variables d’environnement modifiées par un module :

module display {nom_du_module}

Pour charger un module dans son environnement :

module load {nom_du_module}

Pour décharger un module :

module unload {nom_du_module}

Déconfigurer tous les modules déjà chargés :

module purge

changer les différentes versions d’un module :

module switch {ancien_module} {nouveau_module}

Voir aussi

Bibliothèques scientifiques

FFTw HDF5

Comment fonctionne le système de Modules

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Bibliothèques scientifiques

Logiciels scientifiques

Se connecter à EOS

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Documentations obsolètes concernant eos

L’uvprod (obsolète)

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