Gaussian MEEP
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Bibliothèques scientifiques
Voir aussi
Se connecter à EOS
Se connecter à Eos
À partir de la plupart des réseaux académiques toulousains, on peut se connecter sur EOS par ssh :
L’espace-disque
L’espace disque d’EOS
L’ espace disque d’EOS est constitué de trois espaces différents, chacun a une utilisation spécifique.
Lancer un calcul sur EOS
Lancer un calcul sur EOSLe mode interactif Pour la phase de mise au point
Améliorer les performances
Améliorer les performances de vos codes
Vous trouverez dans cette rubrique différents moyens de déboguer votre application, d’améliorer les performances et d’optimiser un calcul sur le système de calcul EOS.
Comment fonctionne le système de Modules
Les commandes module permettent de personnaliser son environnement en termes de compilateurs, librairies, application (calcul, visu, etc...) de manière extrêmement simple.
ParaView
Lancement de ParaView
Obligatoirement à partir d’un nœud graphique.
Attention Si l’environnement openFoam est lancé, la commande ParaView n’est pas disponible : utilisez plutô
EOS schématisé : un peu de vocabulaire
Les termes techniques permettant de caractériser les différentes parties du supercalculateur
Gaussview
Utilisation de Gaussview
Positionner l’environnement gaussian comme indiqué dans l’article sur Gaussian, puis :
XCrySDen
Lancer XCryDen à partir du menu graphique !
Ou... Lancer XCrysDen sur la frontale :
Jmol
Jmol est un outil de visualisation de molécules
Lancer Jmol à partir du menu graphique
Ou... lancer Jmol en ligne de commande :
chdb, an MPI application for embarrasingly parallel problems
Embarrassingly parallel problems
An embarrassingly parallel problem is a problem for which little or no effort is required to separate the problem into a number of parallel tasks [
compiler ses codes sur EOS
Le système de calcul EOS utilise le système d’exploitation linux. Ainsi deux environnements de compilation sont disponibles :
Une simulation en vidéo
Cette page présente une démonstration synthétique de l’usage du supercalculateur EOS.
Salome
SALOME propose des outils de pré/post-traitement et de couplage de codes de calcul pour la simulation numérique, ilintègre un module de visualisation (qui repose sur paraview).
VisIt
Lancement de VisIt
Obligatoirement à partir d’un nœud graphique.
VisIt est accessible à partir du menu graphique visit est également utilisable en ligne de commande :
A ParaView tutorial for parallel visualisation
In this tutorial, we explain how you can use several cores with ParaView for a better interactivity when visualizing huge quantities of data